食品加工凈化車間以采用鋼混或磚砌結構為主，并根據不同產品的需要，在結構設計上，適合具體食品加工的特殊要求。車間的空間要與生產相適應，一般情況下，生產凈化車間內的加工人員的人均擁有面積（除設備外） ，應不少于1.5 平方米。過于擁擠的凈化車間，不僅妨礙生產操作，而且人員之間的相互碰撞，人員工作服與 生產設備的接觸，很容易造成產品污染。

車間的頂面高度不應低于3 米，蒸煮間不應低于5 米。加工區與加工人員的衛生設施，如更衣室，淋浴間和衛生間等，應該在建筑上為聯體結構。水產品，肉類制品和速凍食品的冷庫與加工區也應該是聯體式結構。